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Member Profile

Membership type: full

Silvia Batista

Country of origin: Uruguay Currently in: Uruguay, Montevideo General field of specialization: Biological Systems and Organisms
Academic Background

Degrees

2003 Doctorate Biological Systems and Organisms
1989 Undergraduate Chemical Sciences
Research and Profession

Current Research Activities

Biological Systems and Organisms

Participation in projects (last ten years) As Responsible “Establecimiento de ensambles microbianos en regiones polares sujetas a importantes efectos del cambio climático, su participación en el ciclaje biogeoquímico del carbono, nitrógeno y fósforo”. Instituto Antártico Uruguayo. 2016-2018 “Diseño y evaluación de cepas de Saccharomyces cerevisiae modificadas para co-fermentar xilosa y glucosa a etanol a partir de material lignocelulósico”. ANII FSE_1_2014_1_102664 2015-2017 “Composición de comunidades formadoras de tapetes bacterianos en la Isla del Rey Jorge: I-Caracterización e identificación de expresión de genes asociados al ciclo del N. II- Detección y expresión de genes de biodegradación en comunidades microbianas cercanas a depósitos de combustible”. Instituto Antártico Uruguayo. (Co-responsible: Dra. Luisa Falcón). 2012-2015 “Aplicación de la ingeniería metabólica para la producción de polihidroxialcanoatos por Herbaspirillum seropedicae Z69 a partir de hemicelulosa residual”. ANII-FSE-1-2009-46. 2010-2012 “Optimización de la producción de Poli-3-hidroxibutirato por Herbaspirillum seropedicae”. PDT Area Biotecnología 74/17. 2007-2008 “Perfil de ADN de Poblaciones Microbianas Diazotróficas en Suelos y Lagos de la Península Antártica e Isla Rey Jorge”. Grant: Comisión Sectorial de Investigación Científica (CSIC, UdelaR). 2005-2006 “Estudio de Comunidades Microbianas en Suelos y Lagos de la Península Antártica e isla Rey Jorge: Distribución y Diversidad de Organismos Diazótrofos”. Responsibles: Dr. Silvia Batista and Dr. Paul Gill. Grant: Instituto Antártico Uruguayo (IAU). 2004-2006 “Characterization of C4-dicarboxylate metabolism and a novel succinate uptake system in Rhizobium tropici”. Grant: IFS (International Foundation for Science). 2001-2002 "Producción de polímeros de reserva en bacterias del género Herbaspirillum: evaluación de su posible aplicación industrial como plásticos biodegradables" Grant: CSIC, UdelaR. 2000-2002 As participant: Dr. Julio Campo. “Respuestas bióticas al cambio ambiental global: Evidencias de los ecosistemas terrestres Antárticos y sus servicios ambientales” Fondo Conjunto México-Uruguay. 2013-2014 Dra. Beatriz Mendez. “Optimización de procesos industriales para la obtención de bioplásticos y otros productos” CYTED Area 3: Promoción del desarrollo industrial. P309RT0120. 2010-2013 Dr. Lilian Loperena. “Selección y caracterización de cepas en ecosistemas de la Antártida para la producción de enzimas, biopolímeros y metabolitos, como forma de conservación y desarrollo biotecnológico de los recursos genéticos” CSIC I+D UdelaR. 2007-2009 Responsible: Dr. Paul Gill. Co-responsibles: Dr. Elena Fabiano and Dr. Silvia Batista. “Development of Molecular Tools for Engineering/Selection of More Effective Azoarcus sp., an Endophytic Bacterial Diazotroph of Rice”. Grant: RITE (Research Institute of Innovative Technology for the Earth). 2001-2002

Research Keywords: 
yeast
bioethanol
xylose
polyhydroxykanoate
lignocellulose
Herbaspirillum seropedicae
Antibiotic resistance
antarctica
integron
Horizontal gene transfer
Plasmids

Publications resulting from Research: 


ANTELO, V. , GUEROUT A.M. , MAZEL D. , SOTELO J. , BATISTA S.B. Class 1 integrons in conjugative plasmids of drug-resistant bacteria from Fildes Peninsula of King George Island (maritime Antarctica). 2018. Antarctic Science, v.: 30 1, p.:22 – 28.
CALLEJAS, C. , G. AZZIZ , DE SOUZA EMANUEL , GILL, P.R. , BATISTA S.B. Prokaryotic diversity in four microbial mats on the Fildes Peninsula, King George Island, maritime Antarctica. 2018. Polar Biology, p.:1 – 9.
ALCÁNTARA-HERNÄNDEZ, R.J.; TAŞ, N.; CENTENO, C.M.; VALDESPINO-CASTILLO, P.M.; BATISTA, S.B.; MERINO-IBARRA, M; CAMPO, J.; FALCÖN, L. Bacterial diversity in microbial mats from King George Island, Maritime Antarctica. Polar Biology (Minor revisions).
CATALÁN, A.I.; CALLEJAS, C.; MARTÍNEZ, G.; VARELA, H.; BATISTA, S.B. “Synthesis of polyhydroxybutyrate by Herbaspirillum seropedicae Z69 Lac+ using whey permeate in culture medium”.2017. Asian Journal of Microbiology, Biotechnology & Environmental Sciences. 18(4): 875 – 882.
ANTELO, V.; ROMERO, H.; BATISTA, S.B. “Detection of integron integrase genes on King George Island, Antarctica. March 2015. Advances in Polar Science. doi: 10.13679/j.advps.2015.1.00001. Vol. 26 No1.
ALCÁNTARA-HERNÁNDEZ, R.; CENTENO, C.; PONCE-MENDOZA, A.; BATISTA, S.B.; MERINO-IBARRA, M.; CAMPO, J.; FALCÓN, L. “Characterization and comparison of potential denitrifiers in microbial mats from King George Island, Maritime Antarctica”. 2014. Polar Biology 37: 403–416.
LOPERENA, L.; SORIA, V.; VARELA, H.; LUPO, S.; BERGALLI, A.; GUIGOU, M.; PELLEGRINO, A.; BERNARDO, A.; CALVIÑO, A.; RIVAS, F.; Batista S.B. “Extracellular Enzymes produced by microorganisms isolated from maritime Antarctica”. World Journal of Microbiology & Biotechnology, v.28 5, p.: 2249 - 2256, 2012 ISSN: 09593993
CALLEJAS, C.; GILL, P.R.; CATALÁN, A.I.; AZZIZ, G.; CASTRO, S.; BATISTA, S.B. “Phylotype diversity in a cyanobacterial mat community on King George Island, maritime Antarctica”. World Journal of Microbiology & Biotechnology, v. 27 6, p. 1507-1512, 2010. ISSN/ISBN: 0959-3993.
BATISTA, S.B.; PATRIARCA, E.J.; TATE, R.; MARTÍNEZ-DRETS, G.; GILL, P.R. "An alternative succinate (2-oxoglutarate) transport system in Rhizobium tropici is induced in nodules of Phaseolus vulgaris". Journal of Bacteriology, v.191, p 5057-5067. 2009. ISSN/ISBN: 0021-9193.
CATALÁN, A.I.; FERREIRA, F.; GILL, P.R.; BATISTA, S.B. “Production of polyhydroxyalkanoates by Herbaspirillum seropedicae grown with different sole carbon sources and on lactose when engineered to express the lacZlacY genes”. Enzyme and Microbial Technology, v. 40, p. 1352-1357. 2007. ISSN/ISBN: 0141-0229
ROSCONI, F.; SOUZA, E.; PEDROSA, F.; GILL, P.R.; PLATERO, R.; GONZÁLEZ, C.; GONZÁLEZ, M.; BATISTA, S.B.; FABIANO, E. ”Expression of nifA and nitrogenase structural genes is iron regulated in Herbaspirillum seropedicae Z67”. Fems Microbiology Letters, v. 258, p. 214-219. 2006. ISSN/ISBN: 0378-1097

Chapters in book

MALAN, A.K.; FAGUNDEZ, A.; GILL, P.R.; Batista S.B. “Engineering hemicellulose-derived xylose utilization in Saccharomyces cerevisiae for biotechnological applications”. In: Microbial Models: From Environmental to Industrial Sustainability ed. S. Castro-Sowinski, Springer .
CATALÁN, A.I.; BATISTA, S.B.; KEICO TACIRO, M.; CABRERA GOMEZ, J.G. “Análisis de flujos metabólicos en cultivos alimentados de Herbaspirillum seropedicae durante la síntesis de poli-3-hidroxibutirato” Bioplásticos. Ed.: Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED), Madrid, España, p. 39-47. 2014. ISBN-10: 84-15413-30-0

-Master thesis, PEDECIBA Biology. Lic. Matías Giménez. "Detección y caracterización de plásmidos asociados a resistencia a antibióticos en muestras de la Península Fildes (Isla Rey Jorge)”. 2017 to the present
-PhD thesis, PEDECIBA Biology. Ms. Ana Karen Malan. “Estudio del metabolismo de xilosa y su regulación en Herbaspirillum seropedicae Z69”. 2016 to the present
-Postdoctoral position Dr. Patricia M. Valdespino Castillo. Program: Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación del Distrito Federal (SECITIDF), Mexico. Co-orientator: Dra. Luisa Falcón (UNAM). 2015 to the present
-PhD thesis, PEDECIBA Biology. Ms Verónica Antelo. “Estudio de microorganismos antárticos y expresión de mecanismos de transferencia horizontal de genes”. 2013 to the present
-PhD student, Faculty of Chemistry (UdelaR), PEDECIBA Chemistry. Ms. Ana Inés Catalán “Análisis de flujos metabólicos: estrategia para optimizar la síntesis bacteriana de polímeros de reserva”. 2011-2017
-Master thesis, PEDECIBA Biology. Lic. Ana Karen Malán. “Producción de polihidroxialcanoatos a partir de hidrolizado de hemicelulosa”. 2011-2015
-Master thesis, PEDECIBA Biology. Lic. Verónica Antelo. (Fellow ANII) “Caracterización de comunidades microbianas en suelos de la Isla Rey Jorge. Estudio de mecanismos de transferencia horizontal de genes”. 2008-2012
-Master thesis. PEDECIBA Biology. Lic Cecilia Callejas. (Fellow ANII) “Caracterización de comunidades microbianas en suelos de la Isla Rey Jorge (Antártida marítima)”. 2008-2011
-Co-orientator Master thesis. PEDECIBA Biology. Lic. Ana Inés Catalán (Orientator: Dr. Fernando Ferreira): “Producción de polihidroxibutirato a partir de Herbaspirillum seropedicae”. 2006

Graduate students.

-Thesis of graduation Bach. Matías Giménez: “Detección y estudio de plásmidos en muestras de sedimento/suelo de la Península Fildes (Isla Rey Jorge, Antártida marítima)”. 2014-2016
-Thesis of graduation Bach. Alejandra Fagúndez.: “Diseño de cepas de Saccharomyces cerevisiae capaces de fermentar xilosa a etanol”. 2014-to present
-Thesis of graduation Bach. Carla Silva. “Aislamiento y estudio de bacterias aisladas de muestras de sedimento/suelo colectado en sitios presuntamente contaminados con gas-oil”. 2013-to present
-Thesis of graduation. Lic. of Biology (FC, UdelaR). Bach. Daniela Lima. “Estudio del sistema de dos componentes DctBD y su participación en la expresión de la proteína de transporte KgtP en Rhizobium tropici CIAT899”. (Fellow ANII).
2011
-Thesis of graduation. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Bach. Ana Karen Malán.” “Estudio de la producción de Polihidroxibutirato por Herbaspirillum seropedicae empleando xilosa, glucosa y arabinosa como fuente de carbono” (Fellow ANII). 2010
-Thesis of graduation. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Bach. Jorge Bresciano. “Caracterización de microorganismos aislados de suelos de la Isla Rey Jorge (Antártida marítima)”. 2010
-Thesis of graduation. Trabajo II Lic. Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Cecilia Callejas. “Análisis molecular de matas de cianobacterias-bacterias presentes en la Antártida Marítima” (co-orientator: Dr. Paul Gill). 2008
-Thesis of graduation. Trabajo II Lic. Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Andrea Rodríguez. “Búsqueda e identificación de funciones que participan en la movilidad en Herbaspirillum seropedicae Z67”. (co-orientator: Dr. Paul R. Gill). 2008
-Thesis I. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Cecilia Callejas. “Metabolismo del nitrógeno en cianobacterias”. 2007
-Thesis I. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Andrea Rodríguez. “Mecanismos de movilidad en procariotas”. 2007

Teaching courses
Coordinator Course: “Transferencia horizontal de material genético en bacterias”.
October 2017, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. Financed by PEDECIBA and ANII. October 9-18, 2017
Coordinator Course:”Avances en Ingeniería Metabólica aplicada a la Biotecnología”. Financed by CABBIO, UNU-Biolac y PEDECIBA. April 13-24, 2015
Participation in the course “Estructura, función y variabilidad del genoma bacteriano”. (PEDECIBA Biology). 2008-2011
Participation in the course CABBIO-CYTED “Síntesis de productos biotecnológicos en bacterias desde una perspectiva genómica y metabolómica”. 2011
Participation as teacher and organization of Escuela Regional de Microbiología developed at IIBCE (PEDECIBA Biology, AMSUD Pasteur, ANII). 2009 and 2011




Current profession

Current professional activities type: 
Research
Teaching
I am currently working in an academic Institution dependent of the Government

Affiliations

Microbiology Society
Prizes, Grants and Awards

Other Awards

Oct 2008
First Prize: Concurso CEMPREndimientos para el Reciclaje, CEMPRE (Compromiso Empresarial para el Reciclaje)
Award of CEMPRE (Organization of the Uruguayan Chamber of Industries), for the design of Recycling Proposals
Oct 2008
Investigator Level 3 PEDECIBA Biology
PEDECIBA-Program for the Development of Basic Sciences (from 2008 up to present)
Oct 2012
Investigator Level 3 PEDECIBA Chemistry
PEDECIBA-Program for the Development of Basic Sciences (from 2012 up to present)
Oct 2009
Investigator Level 1. Sistema Nacional de Investigadores- Agencia Nacional de Investigación e Innovación
Investigator SNI Level 1 (2009 up to present)