Member Profile
Silvia Batista
Country of origin: Uruguay Currently in: Uruguay, Montevideo General field of specialization: Biological Systems and Organisms-
Degrees
2003 Doctorate Biological Systems and Organisms1989 Undergraduate Chemical Sciences -
Current Research Activities
Biological Systems and Organisms
Participation in projects (last ten years) As Responsible “Establecimiento de ensambles microbianos en regiones polares sujetas a importantes efectos del cambio climático, su participación en el ciclaje biogeoquímico del carbono, nitrógeno y fósforo”. Instituto Antártico Uruguayo. 2016-2018 “Diseño y evaluación de cepas de Saccharomyces cerevisiae modificadas para co-fermentar xilosa y glucosa a etanol a partir de material lignocelulósico”. ANII FSE_1_2014_1_102664 2015-2017 “Composición de comunidades formadoras de tapetes bacterianos en la Isla del Rey Jorge: I-Caracterización e identificación de expresión de genes asociados al ciclo del N. II- Detección y expresión de genes de biodegradación en comunidades microbianas cercanas a depósitos de combustible”. Instituto Antártico Uruguayo. (Co-responsible: Dra. Luisa Falcón). 2012-2015 “Aplicación de la ingeniería metabólica para la producción de polihidroxialcanoatos por Herbaspirillum seropedicae Z69 a partir de hemicelulosa residual”. ANII-FSE-1-2009-46. 2010-2012 “Optimización de la producción de Poli-3-hidroxibutirato por Herbaspirillum seropedicae”. PDT Area Biotecnología 74/17. 2007-2008 “Perfil de ADN de Poblaciones Microbianas Diazotróficas en Suelos y Lagos de la Península Antártica e Isla Rey Jorge”. Grant: Comisión Sectorial de Investigación Científica (CSIC, UdelaR). 2005-2006 “Estudio de Comunidades Microbianas en Suelos y Lagos de la Península Antártica e isla Rey Jorge: Distribución y Diversidad de Organismos Diazótrofos”. Responsibles: Dr. Silvia Batista and Dr. Paul Gill. Grant: Instituto Antártico Uruguayo (IAU). 2004-2006 “Characterization of C4-dicarboxylate metabolism and a novel succinate uptake system in Rhizobium tropici”. Grant: IFS (International Foundation for Science). 2001-2002 "Producción de polímeros de reserva en bacterias del género Herbaspirillum: evaluación de su posible aplicación industrial como plásticos biodegradables" Grant: CSIC, UdelaR. 2000-2002 As participant: Dr. Julio Campo. “Respuestas bióticas al cambio ambiental global: Evidencias de los ecosistemas terrestres Antárticos y sus servicios ambientales” Fondo Conjunto México-Uruguay. 2013-2014 Dra. Beatriz Mendez. “Optimización de procesos industriales para la obtención de bioplásticos y otros productos” CYTED Area 3: Promoción del desarrollo industrial. P309RT0120. 2010-2013 Dr. Lilian Loperena. “Selección y caracterización de cepas en ecosistemas de la Antártida para la producción de enzimas, biopolímeros y metabolitos, como forma de conservación y desarrollo biotecnológico de los recursos genéticos” CSIC I+D UdelaR. 2007-2009 Responsible: Dr. Paul Gill. Co-responsibles: Dr. Elena Fabiano and Dr. Silvia Batista. “Development of Molecular Tools for Engineering/Selection of More Effective Azoarcus sp., an Endophytic Bacterial Diazotroph of Rice”. Grant: RITE (Research Institute of Innovative Technology for the Earth). 2001-2002
Publications resulting from Research:
ANTELO, V. , GUEROUT A.M. , MAZEL D. , SOTELO J. , BATISTA S.B. Class 1 integrons in conjugative plasmids of drug-resistant bacteria from Fildes Peninsula of King George Island (maritime Antarctica). 2018. Antarctic Science, v.: 30 1, p.:22 – 28.
CALLEJAS, C. , G. AZZIZ , DE SOUZA EMANUEL , GILL, P.R. , BATISTA S.B. Prokaryotic diversity in four microbial mats on the Fildes Peninsula, King George Island, maritime Antarctica. 2018. Polar Biology, p.:1 – 9.
ALCÁNTARA-HERNÄNDEZ, R.J.; TAŞ, N.; CENTENO, C.M.; VALDESPINO-CASTILLO, P.M.; BATISTA, S.B.; MERINO-IBARRA, M; CAMPO, J.; FALCÖN, L. Bacterial diversity in microbial mats from King George Island, Maritime Antarctica. Polar Biology (Minor revisions).
CATALÁN, A.I.; CALLEJAS, C.; MARTÍNEZ, G.; VARELA, H.; BATISTA, S.B. “Synthesis of polyhydroxybutyrate by Herbaspirillum seropedicae Z69 Lac+ using whey permeate in culture medium”.2017. Asian Journal of Microbiology, Biotechnology & Environmental Sciences. 18(4): 875 – 882.
ANTELO, V.; ROMERO, H.; BATISTA, S.B. “Detection of integron integrase genes on King George Island, Antarctica. March 2015. Advances in Polar Science. doi: 10.13679/j.advps.2015.1.00001. Vol. 26 No1.
ALCÁNTARA-HERNÁNDEZ, R.; CENTENO, C.; PONCE-MENDOZA, A.; BATISTA, S.B.; MERINO-IBARRA, M.; CAMPO, J.; FALCÓN, L. “Characterization and comparison of potential denitrifiers in microbial mats from King George Island, Maritime Antarctica”. 2014. Polar Biology 37: 403–416.
LOPERENA, L.; SORIA, V.; VARELA, H.; LUPO, S.; BERGALLI, A.; GUIGOU, M.; PELLEGRINO, A.; BERNARDO, A.; CALVIÑO, A.; RIVAS, F.; Batista S.B. “Extracellular Enzymes produced by microorganisms isolated from maritime Antarctica”. World Journal of Microbiology & Biotechnology, v.28 5, p.: 2249 - 2256, 2012 ISSN: 09593993
CALLEJAS, C.; GILL, P.R.; CATALÁN, A.I.; AZZIZ, G.; CASTRO, S.; BATISTA, S.B. “Phylotype diversity in a cyanobacterial mat community on King George Island, maritime Antarctica”. World Journal of Microbiology & Biotechnology, v. 27 6, p. 1507-1512, 2010. ISSN/ISBN: 0959-3993.
BATISTA, S.B.; PATRIARCA, E.J.; TATE, R.; MARTÍNEZ-DRETS, G.; GILL, P.R. "An alternative succinate (2-oxoglutarate) transport system in Rhizobium tropici is induced in nodules of Phaseolus vulgaris". Journal of Bacteriology, v.191, p 5057-5067. 2009. ISSN/ISBN: 0021-9193.
CATALÁN, A.I.; FERREIRA, F.; GILL, P.R.; BATISTA, S.B. “Production of polyhydroxyalkanoates by Herbaspirillum seropedicae grown with different sole carbon sources and on lactose when engineered to express the lacZlacY genes”. Enzyme and Microbial Technology, v. 40, p. 1352-1357. 2007. ISSN/ISBN: 0141-0229
ROSCONI, F.; SOUZA, E.; PEDROSA, F.; GILL, P.R.; PLATERO, R.; GONZÁLEZ, C.; GONZÁLEZ, M.; BATISTA, S.B.; FABIANO, E. ”Expression of nifA and nitrogenase structural genes is iron regulated in Herbaspirillum seropedicae Z67”. Fems Microbiology Letters, v. 258, p. 214-219. 2006. ISSN/ISBN: 0378-1097
Chapters in book
MALAN, A.K.; FAGUNDEZ, A.; GILL, P.R.; Batista S.B. “Engineering hemicellulose-derived xylose utilization in Saccharomyces cerevisiae for biotechnological applications”. In: Microbial Models: From Environmental to Industrial Sustainability ed. S. Castro-Sowinski, Springer .
CATALÁN, A.I.; BATISTA, S.B.; KEICO TACIRO, M.; CABRERA GOMEZ, J.G. “Análisis de flujos metabólicos en cultivos alimentados de Herbaspirillum seropedicae durante la síntesis de poli-3-hidroxibutirato” Bioplásticos. Ed.: Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED), Madrid, España, p. 39-47. 2014. ISBN-10: 84-15413-30-0
-Master thesis, PEDECIBA Biology. Lic. Matías Giménez. "Detección y caracterización de plásmidos asociados a resistencia a antibióticos en muestras de la Península Fildes (Isla Rey Jorge)”. 2017 to the present
-PhD thesis, PEDECIBA Biology. Ms. Ana Karen Malan. “Estudio del metabolismo de xilosa y su regulación en Herbaspirillum seropedicae Z69”. 2016 to the present
-Postdoctoral position Dr. Patricia M. Valdespino Castillo. Program: Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación del Distrito Federal (SECITIDF), Mexico. Co-orientator: Dra. Luisa Falcón (UNAM). 2015 to the present
-PhD thesis, PEDECIBA Biology. Ms Verónica Antelo. “Estudio de microorganismos antárticos y expresión de mecanismos de transferencia horizontal de genes”. 2013 to the present
-PhD student, Faculty of Chemistry (UdelaR), PEDECIBA Chemistry. Ms. Ana Inés Catalán “Análisis de flujos metabólicos: estrategia para optimizar la síntesis bacteriana de polímeros de reserva”. 2011-2017
-Master thesis, PEDECIBA Biology. Lic. Ana Karen Malán. “Producción de polihidroxialcanoatos a partir de hidrolizado de hemicelulosa”. 2011-2015
-Master thesis, PEDECIBA Biology. Lic. Verónica Antelo. (Fellow ANII) “Caracterización de comunidades microbianas en suelos de la Isla Rey Jorge. Estudio de mecanismos de transferencia horizontal de genes”. 2008-2012
-Master thesis. PEDECIBA Biology. Lic Cecilia Callejas. (Fellow ANII) “Caracterización de comunidades microbianas en suelos de la Isla Rey Jorge (Antártida marítima)”. 2008-2011
-Co-orientator Master thesis. PEDECIBA Biology. Lic. Ana Inés Catalán (Orientator: Dr. Fernando Ferreira): “Producción de polihidroxibutirato a partir de Herbaspirillum seropedicae”. 2006
Graduate students.
-Thesis of graduation Bach. Matías Giménez: “Detección y estudio de plásmidos en muestras de sedimento/suelo de la Península Fildes (Isla Rey Jorge, Antártida marítima)”. 2014-2016
-Thesis of graduation Bach. Alejandra Fagúndez.: “Diseño de cepas de Saccharomyces cerevisiae capaces de fermentar xilosa a etanol”. 2014-to present
-Thesis of graduation Bach. Carla Silva. “Aislamiento y estudio de bacterias aisladas de muestras de sedimento/suelo colectado en sitios presuntamente contaminados con gas-oil”. 2013-to present
-Thesis of graduation. Lic. of Biology (FC, UdelaR). Bach. Daniela Lima. “Estudio del sistema de dos componentes DctBD y su participación en la expresión de la proteína de transporte KgtP en Rhizobium tropici CIAT899”. (Fellow ANII).
2011
-Thesis of graduation. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Bach. Ana Karen Malán.” “Estudio de la producción de Polihidroxibutirato por Herbaspirillum seropedicae empleando xilosa, glucosa y arabinosa como fuente de carbono” (Fellow ANII). 2010
-Thesis of graduation. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Bach. Jorge Bresciano. “Caracterización de microorganismos aislados de suelos de la Isla Rey Jorge (Antártida marítima)”. 2010
-Thesis of graduation. Trabajo II Lic. Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Cecilia Callejas. “Análisis molecular de matas de cianobacterias-bacterias presentes en la Antártida Marítima” (co-orientator: Dr. Paul Gill). 2008
-Thesis of graduation. Trabajo II Lic. Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Andrea Rodríguez. “Búsqueda e identificación de funciones que participan en la movilidad en Herbaspirillum seropedicae Z67”. (co-orientator: Dr. Paul R. Gill). 2008
-Thesis I. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Cecilia Callejas. “Metabolismo del nitrógeno en cianobacterias”. 2007
-Thesis I. Lic. of Biochemistry (FC, UdelaR). Lic. Andrea Rodríguez. “Mecanismos de movilidad en procariotas”. 2007
Teaching courses
Coordinator Course: “Transferencia horizontal de material genético en bacterias”.
October 2017, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. Financed by PEDECIBA and ANII. October 9-18, 2017
Coordinator Course:”Avances en Ingeniería Metabólica aplicada a la Biotecnología”. Financed by CABBIO, UNU-Biolac y PEDECIBA. April 13-24, 2015
Participation in the course “Estructura, función y variabilidad del genoma bacteriano”. (PEDECIBA Biology). 2008-2011
Participation in the course CABBIO-CYTED “Síntesis de productos biotecnológicos en bacterias desde una perspectiva genómica y metabolómica”. 2011
Participation as teacher and organization of Escuela Regional de Microbiología developed at IIBCE (PEDECIBA Biology, AMSUD Pasteur, ANII). 2009 and 2011
Current profession
Current professional activities type:ResearchTeachingI am currently working in an academic Institution dependent of the Government
Affiliations
Microbiology Society -
Other Awards
Oct 2008First Prize: Concurso CEMPREndimientos para el Reciclaje, CEMPRE (Compromiso Empresarial para el Reciclaje)Award of CEMPRE (Organization of the Uruguayan Chamber of Industries), for the design of Recycling ProposalsOct 2008Investigator Level 3 PEDECIBA BiologyPEDECIBA-Program for the Development of Basic Sciences (from 2008 up to present)Oct 2012Investigator Level 3 PEDECIBA ChemistryPEDECIBA-Program for the Development of Basic Sciences (from 2012 up to present)Oct 2009Investigator Level 1. Sistema Nacional de Investigadores- Agencia Nacional de Investigación e InnovaciónInvestigator SNI Level 1 (2009 up to present)
